La Scuola rientra nel novero delle istituzioni con ordinamento speciale, che in Italia sono sette: oltre alle tre toscane (Scuola Sant'Anna, Scuola Normale, entrambe a Pisa, e appunto Imt), ci sono la Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati (Sissa) a Trieste, il Gran Sasso Science Institute all'Aquila, l'Istituto di Studi Superiori a Pavia e la Scuola Superiore Meridionale a Napoli.
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